Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Lmo1Q924W9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lmo1Q924W9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Lmo1Q924W9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Lmo1Q924W9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Lmo1Q924W9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Lmo1Q924W9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Lmo1Q924W9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Lmo1Q924W9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Lmo1Q924W9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Lmo1Q924W9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Lmo1Q924W9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Lmo1Q924W9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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