Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Clip1Q922J3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms