Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Afg3l1Q920A7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Afg3l1Q920A7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Afg3l1Q920A7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Afg3l1Q920A7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Afg3l1Q920A7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Afg3l1Q920A7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Afg3l1Q920A7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Afg3l1Q920A7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms