Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpe65Q91ZQ5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpe65Q91ZQ5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms