Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vps11Q91W86 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps11Q91W86 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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