Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd3Q91W18 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd3Q91W18 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms