Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK1

Snrnp25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp25Q8VIK1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snrnp25Q8VIK1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp25Q8VIK1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp25Q8VIK1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp25Q8VIK1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp25Q8VIK1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Snrnp25Q8VIK1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms