Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE1

Lmcd1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmcd1Q8VEE1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lmcd1Q8VEE1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms