Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc115Q8VE99 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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