Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rprd1aQ8VDS4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1aQ8VDS4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms