Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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