Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Uhrf1Q8VDF2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Uhrf1Q8VDF2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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