Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Zcchc18Q8VD24 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zcchc18Q8VD24 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Zcchc18Q8VD24 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Zcchc18Q8VD24 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Zcchc18Q8VD24 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Zcchc18Q8VD24 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Zcchc18Q8VD24 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Zcchc18Q8VD24 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Zcchc18Q8VD24 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zcchc18Q8VD24 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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