Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dnajc28Q8VCE1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Dnajc28Q8VCE1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms