Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssx2ipQ8VC66 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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