Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clptm1Q8VBZ3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms