Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cops8Q8VBV7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cops8Q8VBV7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms