Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ClmpQ8R373 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms