Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Impg1Q8R1W8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Impg1Q8R1W8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms