Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssh3Q8K330 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssh3Q8K330 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms