Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd3Q8K2F0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Brd3Q8K2F0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms