Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scara5Q8K299 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scara5Q8K299 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms