Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Abcf3Q8K268 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Abcf3Q8K268 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Abcf3Q8K268 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcf3Q8K268 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Abcf3Q8K268 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Abcf3Q8K268 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Abcf3Q8K268 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcf3Q8K268 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Abcf3Q8K268 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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