Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Cldn34c1Q8K193 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Cldn34c1Q8K193 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Cldn34c1Q8K193 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34c1Q8K193 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Cldn34c1Q8K193 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Cldn34c1Q8K193 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cldn34c1Q8K193 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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