Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tbc1d23Q8K0F1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms