Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn3Q8K045 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkn3Q8K045 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms