Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Afg3l2Q8JZQ2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Afg3l2Q8JZQ2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms