Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHB8

Ttll5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, mousemouse

Predictions only

Length 1,328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll5Q8CHB8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
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Ttll5Q8CHB8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Ttll5Q8CHB8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Ttll5Q8CHB8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Ttll5Q8CHB8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Ttll5Q8CHB8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Ttll5Q8CHB8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Ttll5Q8CHB8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Ttll5Q8CHB8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ttll5Q8CHB8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ttll5Q8CHB8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ttll5Q8CHB8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Ttll5Q8CHB8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ttll5Q8CHB8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms