Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cdkl1Q8CEQ0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms