Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc28aQ8CEI3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc28aQ8CEI3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms