Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc63Q8CDV6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms