Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc87Q8CDL9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms