Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo43Q8CDI2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo43Q8CDI2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo43Q8CDI2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo43Q8CDI2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo43Q8CDI2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fbxo43Q8CDI2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo43Q8CDI2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms