Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE8

Spdye4b, 4933411G11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4bQ8CDE8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spdye4bQ8CDE8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms