Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lrif1Q8CDD9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lrif1Q8CDD9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lrif1Q8CDD9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lrif1Q8CDD9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrif1Q8CDD9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Lrif1Q8CDD9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms