Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phtf2Q8CB19 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf2Q8CB19 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms