Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fbxo48Q8CAT8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fbxo48Q8CAT8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fbxo48Q8CAT8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fbxo48Q8CAT8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fbxo48Q8CAT8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fbxo48Q8CAT8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fbxo48Q8CAT8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fbxo48Q8CAT8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fbxo48Q8CAT8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Fbxo48Q8CAT8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms