Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Atg4aQ8C9S8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Atg4aQ8C9S8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Atg4aQ8C9S8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Atg4aQ8C9S8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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Atg4aQ8C9S8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg4aQ8C9S8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg4aQ8C9S8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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