Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc159Q8C963 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc159Q8C963 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms