Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nlrp4bQ8C6J9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms