Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Ccdc113Q8C5T8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc113Q8C5T8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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