Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TdrpQ8C5P7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TdrpQ8C5P7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms