Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Defa22Q8C1N8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms