Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nhlrc2Q8BZW8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nhlrc2Q8BZW8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms