Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tnfsfm13Q8BXS2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfsfm13Q8BXS2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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