Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Iffo1Q8BXL9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Iffo1Q8BXL9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Iffo1Q8BXL9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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