Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube3dQ8BX13 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ube3dQ8BX13 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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