Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp38Q8BW70 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Usp38Q8BW70 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp38Q8BW70 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Usp38Q8BW70 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp38Q8BW70 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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Usp38Q8BW70 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Usp38Q8BW70 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp38Q8BW70 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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