Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rccd1Q8BTU7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms