Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rd3Q8BRE0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rd3Q8BRE0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms